Começou a ser construído no ano de 1642, sendo acabado no ano seguinte. Dispunha de Igreja, convento, dormitórios, celas, corredores, todas as oficinas, campanário com sinos e tanque para água. Habitavam o convento, em 1709, 14 religiosos, 7 coristas e 4 leigos; 13 religiosos, 4 coristas e 4 lei-gos, em 1732 e, em 1825, 5 religiosos, 5 coristas e 3 religiosos. Em consequência da extinção das ordens religiosas (1834) foi este convento cedido à Irman-dade da Misericórdia para aí instalar o seu hospital (1848). Por troca, foi a Igreja da Misericórdia cedida à Câmara Municipal para acomodação dos serviços administrativos, conservatória e escola de instrução primária para o sexo masculino (1872).
A Irmandade da Misericórdia foi instituída a 13 de Abril de 1543 e a sua igreja construída no local da Casa do Espírito Santo (actual Rua da Capela), em data anterior. Foi criada para a prática de actos de culto, de obras de caridade e para dar sepultura aos mortos. Do primeiro e único hospital da Misericórdia, concluído em 1708, foi instituidora D. Beatriz de Mello (? - 1682). Por testamento da Barone-sa do Ribeiro recebeu, em 1900, a quantia de 15 000 reis. Esta Irmandade foi, também Montepio dos Marítimos.